Météo à Fontenotte

Le mois le plus chaud est juillet, avec 27,0 °C de maximale moyenne ; le plus froid est janvier, avec −1,4 °C de minimale moyenne. Il tombe 1 216 mm de pluie sur l'année, de 88 mm en avril (le mois le plus sec) à 121 mm en décembre (le plus arrosé).

Depuis 1982, l'État a reconnu 2 fois l'état de catastrophe naturelle à Fontenotte pour un phénomène météorologique : 1 pour des inondations et coulées de boue (en 1999) et 1 pour la sécheresse (en 2018). Le plus récent, publié au Journal officiel le 9 août 2019, vise « sécheresse » du 1er octobre 2018 au 31 décembre 2018. Un arrêté reconnaît un état de catastrophe naturelle pour une période donnée, il ne mesure ni les dégâts ni l'intensité du phénomène.

Météo-France a placé le département du Doubs en vigilance orange ou rouge 16 jours en 2023, 11 jours en 2024 et 17 jours en 2025 (jours comptés au niveau le plus élevé de la journée), dont 1 jour en rouge. Les phénomènes les plus souvent en cause sont canicule (19 jours), orages (15 jours) et crues (4 jours). Ces niveaux concernent le département entier ; Fontenotte a pu être épargnée ou touchée plus fort.

Sur 1991-2020, d'après la station de Pouligney, Fontenotte compte en moyenne 1 216 mm de pluie par an (dans la moyenne des communes du département), 90 jours de gel par an (dans la moyenne des communes du département) et 27 jours à 30 °C ou plus par an (plus de jours chauds que 90 % des communes du département). 534 communes du département entrent dans la comparaison. Ce sont les mesures de la station qui sont comparées, non celles de la commune.

La prévision vient du modèle AROME de Météo-France (maille de 2,5 km), lu au point de grille le plus proche de la mairie, à 0,3 km ; la température est corrigée de l'altitude du village (369 m). Elle est mise à jour plusieurs fois par jour : l'heure du run est toujours affichée.